Balai Penelitian dan Pengembangan Banda Aceh Memiliki fasilitas Laboratorium untuk menunjang kegiatan penelitian.
Laboratorium di Loka Penelitian dan Pengembangan Biomedis Aceh terdiri dari:
- Laboratorium Parasitologi/Entomologi
Pemeriksaan yang dapat dilakukan di laboratorium Parsasitologi/Entomologi adalah: pemeriksaan slide malaria, filaria, telur cacing dan identifikasi nyamuk.
- Laboratorium Virologi
Pemeriksaan yang dapat dilakukan di laboratorium Virologi adalah: pemeriksaan Flu A dengan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) Konvensional.
- Laboratorium Bakteriologi
Pemeriksaan yang dapat dilakukan di laboratorium Bakteriologi adalah: Pemeriksaan bakteriologi air metode MPN, kultur bakteri pada ulkus diabetikum metode Streak Plate, teknik pewarnaan gram untuk menentukan bakteri gram positif dan gram negatif, identifikasi Mycobacterium tuberculosis secara mikroskopis, identifikasi Mycobacterium tuberculosis dan bakteri E. coli dengan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) Konvensional.
- Laboratorium Serologi/Immunologi
- Laboratorium Kimia Farmasi
- Laboratorium Biakan Jaringan
- Laboratorium Hewan Coba